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        蔡元培领导创建中国研究院，是他继担任民国教育总长、北大校长之后，对于中国文教科研事业所做的又一个丰碑式功绩，以至有人评价，这是“蔡先生对于我国学术之最大贡献”。

        1949年，国民党当局迁台。12月，历史语言研究所的全部以及数学研究所的部分共二千多箱重要图书、文物、仪器、设备运往台湾，迁至台北的台湾大学，暂存在桃园县杨梅镇今桃园市杨梅区火车站仓库。其余研究所皆留置于中国大陆，并发展为后来中国科学院之主体中国科学院早期的外文译名亦一直沿用AcademiaSinica，现多采用英语eseAcademyofSces，但仍有部分研究所沿用拉丁文译法。

        由于多数院士及中央研究院第一届院士会议所选出之第三届评议员32人都留在大陆或留置国外，在台者仅有吴大猷、朱家骅、凌鸿勋、李先闻、吴敬恒、胡适、傅斯年、李济、董作宾、王世杰、王宠惠等人，不足法定人数，两会无法召集并行使职权，在一段时间里，台“中研院”陷入半停顿状态。

        1954年，经朱家骅多方奔走，在台北市南港区现址营建院区。植物研究所在台“复所”。

        1955年，成立中央研究院近代史研究所及中央研究院近民族研究所筹备处。

        1957年，多方讨论出“以报到登记人数为实有全体人数”之办法并呈奉台湾当局领导人令准，于4月2日在台举行第二次院士会议，4月3日举行第三届评议会首次会议。

        同年12月，胡适继朱家骅之后担任院长，次年正式就职。化学研究所在台“复所”。

        经胡适、王世杰、钱思亮、吴大猷、李远哲、翁启惠等院长之戮力经营，台湾的“中央研究院”逐渐形成了今日之规模。

        这为后话。

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